Di seguito sono riportati gli effetti indesiderati di iodio, organizzati secondo la classificazione sistemica organica MedDRA. Non sono disponibili dati sufficienti per stabilire la frequenza dei singoli effetti elencati.

Sistemi e organi	Effetto indesiderato
Patologie del sistema emolinfopoietico	Eosinofilia, linfoadenopatia
Disturbi del sistema immunitario	Ipersensibilità
Patologie endocrine	Ipertiroidismo (morbo di Basedow), ipotiroidismo, gozzo. Lo iodio può interferire con le prove di funzionalità tiroidea
Patologie della cute e del tessuto sottocutaneo	Orticaria, angioedema, emorragia cutanea. L’inalazione di vapori di iodio è molto irritante per le mucose
Disturbi del metabolismo e della nutrizione	Acidosi metabolica
Disturbi psichiatrici	Depressione, insonnia
Patologie del sistema nervoso	Gusto metallico, cefalea
Patologie cardiache e vascolari	Ipotensione, tachicardia
Patologie respiratorie, toraciche e mediastiniche	Dispnea, edema polmonare, broncospasmo
Patologie gastrointestinali	Nausea, vomito, diarrea, dolore addominale
Patologie renali e urinarie	Insufficienza renale
Patologie dell’apparato riproduttivo e della mammella	Impotenza
Patologie sistemiche e condizioni relative alla sede di somministrazione	Febbre

Traumatismo, avvelenamento e complicazioni da procedura: l’uso prolungato può provocare una serie di effetti avversi chiamati nel loro complesso "iodismo", alcuni dei quali possono essere dovuti ad ipersensibilità. Questi effetti avversi includono sapore metallico, aumento della salivazione, bruciore e dolore alla bocca; possono manifestarsi anche rinite acuta, sindrome simil–coriza, gonfiore e infiammazione della gola, irritazione e gonfiore agli occhi e aumento della lacrimazione. Si possono sviluppare edema polmonare, dispnea e bronchite.